С контрагентом можно заключить соглашение о применении простой или усиленной неквалифицированной электронной подписи. Тогда заверенные ею электронные первичные документы организация вправе использовать для бухгалтерского и налогового учета. Это следует из письма Минфина. На такую возможность ранее указывали как само министерство, так и ФНС.

Основание: Письмо Минфина России от 12.09.2016г. № 03-03-06/2/53176.